Con la finalidad de caracterizar la morbilidad y mortalidad por sepsis en la Unidad de Cuidados Intensivos Neonatales del Hospital General Universitario "Vladimir Ilich Lenin," se realizó un estudio descriptivo de 434 pacientes a los que se diagnosticó sepsis, en el período comprendido de enero del 2006 a diciembre del 2008. La incidencia de sepsis fue de 20,5 x 1000 nacidos vivos (NV), de ellas 15,3 x 1000 NV presentó sepsis precoz y 5,2 x 1000 NV tardía. La tasa de infección fue de 14,2 x 100 egresos. La sepsis de inicio precoz es frecuente (72,3%) y dentro de sus causas la Bronconeumonía (71,9%) como localización más común. Los microorganismos gramnegativos fueron los aislados con mayor frecuencia (57,6%) representado por el género Citrobacter. La ventilación por sepsis se comporta con tendencia creciente. La Bronconeumonía de inicio precoz fue la localización con mayor porcentaje y mortalidad con 70% en hallazgos necrópsicos. La tasa de mortalidad por sepsis es de 0,47 x 1000 NV. Los pretérminos y bajo peso tienen mayores probabilidades de morir si adquieren una sepsis que los nacidos a término de buen peso. La mortalidad neonatal por sepsis se observó con mayor frecuencia en las primeras 72 horas de vida. Se diseñó un algoritmo de trabajo para disminuir la mortalidad por sepsis.