Se realizó un estudio descriptivo longitudinal en la unidad de cuidados intensivos neonatales desde enero del 2007 a diciembre del 2010. El universo de estudio estuvo constituido por los 191 pacientes ingresados en dicha unidad por afecciones quirúrgicas y la muestra los 57 niños que presentaron infección neonatal y se documentó microbiológicamente la etiología. La información primaria se obtuvo del libro de registro de la infección hospitalaria en el servicio, se revisaron las historias clínicas para conocer sitio de la infección, factores de riesgo, positividad de medios diagnósticos y letalidad por esta enfermedad, se revisaron las actas del comité de infección del hospital. Los resultados obtenidos fueron sometidos a análisis, se expusieron en tablas confeccionadas al efecto para su mejor comprensión expresándose en números y por cientos. Los resultados obtenidos fueron: la infección neonatal se presentó en el 29.8% de los pacientes con afecciones quirúrgicas, los mayores por cientos correspondieron a los neonatos con síndrome oclusivo intestinal, la atresia esofágica fue donde se presentó un mayor por ciento de niños a través del sitio quirúrgico con un 61.53%, los pacientes con más factores de riesgo padecieron la enfermedad, los hongos predominaron sobre los gérmenes grampositivos y gramnegativos. De los medios diagnósticos el hemocultivo fue el que mayor positividad aportó y la mortalidad fue baja. Se concluye que las infecciones neonatales quirúrgicas están en proporción directa con los factores de riesgo. Los cuidados de enfermería en la atención del neonato quirúrgico deben protocolizarse para lograr mejores resultados.